Середня загальноосвітня школа№46 м. Києва заснована у 1964 році. Заклад здійснював освітню діяльність за рівнем «загальна середня освіта» згідно ліцензії, виданої Головним управлінням освіти Київської міської державної адміністрації 21.05.2007р.
СЗШ №46 надає серію послуг для задоволення освітніх потреб усіх категорій населення. Центром діяльності школи є особистість дитини, формування її життєвих принципів. У навчальному закладі визначена українська мова навчання і запроваджено поглиблене вивчення української мови та літератури, математики , біології, технології.
Впродовж багатьох років школа є базовою Державного педагогічного університету ім. Драгоманова. Студенти університету щорічно на базі школи проходять пасивну та активну педагогічну практики.